Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms