Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms