Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms