Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm12479-201ENSMUST00000120731 1585 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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