Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ctdsp2Q8BX07 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ctdsp2Q8BX07 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ctdsp2Q8BX07 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Ctdsp2Q8BX07 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Ctdsp2Q8BX07 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Ctdsp2Q8BX07 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Ctdsp2Q8BX07 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Ctdsp2Q8BX07 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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