Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4aQ8BW72 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms