Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms