Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms