Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms