Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms