Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms