Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms