Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms