Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpped1Q8BFS6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cpped1Q8BFS6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms