Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc172Q810N9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms