Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmcc2Q80W04 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms