Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms