Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Mro-206ENSMUST00000179472 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms