Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms