Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrc2aQ7TSC1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms