Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sbno2Q7TNB8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sbno2Q7TNB8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sbno2Q7TNB8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sbno2Q7TNB8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms