Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Eci3Q78JN3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Eci3Q78JN3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Eci3Q78JN3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Eci3Q78JN3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Eci3Q78JN3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Eci3Q78JN3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Eci3Q78JN3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Eci3Q78JN3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Eci3Q78JN3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Eci3Q78JN3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Eci3Q78JN3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Eci3Q78JN3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Eci3Q78JN3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms