Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms