Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms