Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms