Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc2Q6PDG5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms