Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms