Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms