Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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