Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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