Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Krt40Q6IFX3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Krt40Q6IFX3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Krt40Q6IFX3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Krt40Q6IFX3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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