Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms