Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms