Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms