Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q6DFW0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6DFW0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms