Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rftn1Q6A0D4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rftn1Q6A0D4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rftn1Q6A0D4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rftn1Q6A0D4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Rftn1Q6A0D4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rftn1Q6A0D4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rftn1Q6A0D4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rftn1Q6A0D4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rftn1Q6A0D4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rftn1Q6A0D4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rftn1Q6A0D4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rftn1Q6A0D4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rftn1Q6A0D4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rftn1Q6A0D4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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