Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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