Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms