Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrn1Q61809 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrn1Q61809 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lrrn1Q61809 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lrrn1Q61809 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Lrrn1Q61809 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms