Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rbbp7Q60973 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbbp7Q60973 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbbp7Q60973 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbbp7Q60973 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbbp7Q60973 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbbp7Q60973 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbbp7Q60973 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rbbp7Q60973 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rbbp7Q60973 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms