Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mkrn3Q60764 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms