Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Tdrd5Q5VCS6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Tdrd5Q5VCS6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Tdrd5Q5VCS6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Tdrd5Q5VCS6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Tdrd5Q5VCS6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd5Q5VCS6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd5Q5VCS6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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