Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms