Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms