Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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