Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Defa20Q45VN2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Defa20Q45VN2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Defa20Q45VN2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Defa20Q45VN2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Defa20Q45VN2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Defa20Q45VN2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Defa20Q45VN2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa20Q45VN2 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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