Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Krtap9-3Q3V2C1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Krtap9-3Q3V2C1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Krtap9-3Q3V2C1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Krtap9-3Q3V2C1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Krtap9-3Q3V2C1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Krtap9-3Q3V2C1 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms