Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2Q3V1H1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms