Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Lrrc43Q3V0L5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Lrrc43Q3V0L5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Lrrc43Q3V0L5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Lrrc43Q3V0L5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Lrrc43Q3V0L5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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