Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms